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ProtModernBERT:低算力蛋白质语言模型发布

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AI 综述

Alberto Martínez等人发布蛋白质语言模型ProtModernBERT,在氨基酸序列上预训练,称其在二级结构预测、无序预测、亚细胞定位及ProteinGym零样本功能基准上,性能匹配或接近Amplify-120M与ProtBert,同时预训练FLOPs最多减少80%至90%。 该模型面向低算力场景,采用现代化BERT式架构,研究团队将其与ProtBert、Amplify和ESM2在多项监督结构任务上进行了对比。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

报道时间线

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10月15日
  1. arXiv cs.LG
    ProtModernBERT:面向低算力场景的高效蛋白质语言建模

    ProtModernBERT 是一个在氨基酸序列上预训练的现代化 BERT 式蛋白质语言模型,在二级结构预测、无序预测、亚细胞定位及 ProteinGym 零样本功能基准上,性能匹配或接近 Amplify-120M 与 ProtBert,同时预训练 FLOPs 最多减少 80-90%。

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