分子编码器能否在没有实验读数的情况下预测表型活性？

研究评估了 CLOOME、CellCLIP 等基于分子-形态配对数据对比预训练的分子编码器能否作为表型预测的廉价替代方案。在控制预训练边界泄漏和表型活性与细胞毒性相关性两个混杂因素后，六种表征（含匹配 CLOOME 输入与层数的非预训练 MLP 对照）在两个 Cell Painting 筛选中均显示，预训练分子编码器相较普通理化描述符无明显优势，且毒性通常比表型活性更易预测。